في إطار الخطة القومية لتطوير التعليم العالي، وما أقرته وزارة التعليم العالي والمجـلس الآعلي للجامعات من ضرورة وجود هياكل ثابتة ضمن الهيكل التنظيمي للجامعات المصرية لإدارة مشروعات التطوير داخل كل جامعة ووحداتها المختلفة، وفي إطار الخطة الإستراتيجية لتطوير الجامعة، تم إنشاء وحدة إدارة مشروعات التطوير وبجامعة بنها.
تتمثل رسالة الوحدة في حشد وتكثيف الجهود لتطوير وتحديث أداء وحدات الجـــامعة التعليمي والبحثية والإدارية، لتنمية الطاقات البشرية والمادية، من خلال مجموعة متـكاملة من المشروعات المؤسسية والتنموية، للوصول إلي مستويات مرموقة من جودة الأداء والتميز بما يتواءم مع المعايير القومية والعالمية